Molekulare Medizin (Bachelorstudium) (SS 2024)
Modul MM 4.1 - Bausteine des Lebens 4 - Life Sciences 3 für Molekularmediziner*innen - NGS

Lecturer

Theoretisches Ziel: Einführung in die Hochdurchsatzsequenzierung und in dessen bioinformatische Auswertung.

Inhalte des Kurses: · Der Kurs wird einen praktischen und einen bioinformatischen Teil enthalten.

Einführung in NGS Technologien (Wiederholung VO Coassin aus „Modul MM 2.2: Molekularbiologische Methoden II“)
Kurze Vertiefung in third generation sequencing Technologien
Qualitätskontrolle und Aufreinigung von PCR Produkten, die das gesamte mitochondriale Genom darstellen
Next Generation Sequenzierung auf einem Oxford Nanopore Sequencing System (Ziel wird noch bekanntgegeben)
Einführung in die bioinformatische Auswertung von NGS Daten (Abläufe, klassische Dateitypen, eventuell kurze Einführung in UNIX/Linux-Systeme, Konzepte zur reproduzierbaren Datenanalyse)
Rohdatenprozessierung und Qualitätskontrolle der Daten
Alignment zum Referenzgenom, Bestimmung der Genomabdeckung, Mutationsanalyse

Termin im Sommersemester 2024: 23.4-26.4